Actualités

INRAE - Luc Delaby
Article

02 novembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Quand les chromosomes des bovins s’emmêlent : détecter les anomalies génétiques pour mieux les prévenir

Chez les bovins, comme chez tous les animaux, le matériel génétique est contenu dans des paires de chromosomes, dont chaque exemplaire est réparti aléatoirement lors de la formation des gamètes (spermatozoïdes ou ovocytes). Au cours de ce processus, il peut arriver que du matériel génétique d’un chromosome se déplace vers un autre n’appartenant pas à la même paire, c’est ce que l’on appelle un réarrangement interchromosomique. La fécondation avec un gamète contenant un ou plusieurs chromosomes réarrangés causera un manque ou un surplus de gènes chez l’embryon et aboutira dans la plupart des cas à sa mort. Pour la première fois, des généticiens d’INRAE, en collaboration avec la société ELIANCE, ont mené une étude de population (sur 5 571 taureaux d’insémination) pour quantifier l’occurrence de ces anomalies, leurs origines et leurs conséquences pour les animaux. Leurs résultats, publiés dans Genome Research, montrent qu’1 taureau sur 450 serait porteur d’un réarrangement interchromosomique, avec des conséquences sur la santé et la fertilité des animaux touchés qui coûteraient à la filière plus d’1 million d’euros par taureau d’insémination porteur. Cette étude se base sur les millions de données de génotypage générées en routine pour l’évaluation génomique des taureaux d’insémination et de leurs descendants. L’approche utilisée est la première étape vers un dépistage généralisé de ces anomalies chromosomiques.
INRAE M. Dupont-Nivet
Article

02 novembre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

La sélection génétique pourrait aider à réduire la mortalité dans les élevages de truite lors des vagues de chaleur

Dans une étude publiée dans Genetics Selection Evolution, des scientifiques de l’UMR de Génétique Animale et Biologie Intégrative – GABI (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Jouy-en-Josas) ont décrit l’architecture génétique de la résistance à l’hyperthermie aiguë, soit la capacité des poissons à survivre à des températures élevées. Ils ont montré que les variations de performance pour ce caractère sont à 29% d’origine génétique dans une population commerciale française, attestant d’un potentiel important d’amélioration génétique. Les corrélations génétiques de ce caractère avec les principaux caractères de production – croissance, % de gras intramusculaire et rendement de carcasse – sont proches de zéro. La sélection pour la résistance à l'hyperthermie aiguë ne devrait donc pas avoir d'impact sur ces caractères et vice-versa.
INRAE
Article

02 novembre 2023

Rédaction: GABI - Edition P. Huan

Effet de l'inflammation sur les marques épigénétiques et leur persistance au cours des lactations successives

L’objectif de ces travaux récemment publiés a été de documenter la contribution de l’épigénétique à la santé et à la longévité des animaux.
INRAE
Article

14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Campagne annuelle de mobilité INRAE : consulter les postes ouverts pour rejoindre les unités SAPS

La campagne annuelle de mobilité et la campagne de « mobilité métiers d’avenir » sont ouvertes. Les candidatures pourront être déposées jusqu’au 11 septembre 2023. La campagne est ouverte à l’ensemble des fonctionnaires et agents en CDI de la Fonction Publique.
Article

14 septembre 2023

Rédaction: BIPAR - Edition P. Huan

Diplome Universitaire zoonoses liées aux tiques : Impact pour l’Homme et l’animal dans une approche One Health

Ouverture des inscriptions à la 3ème édition du DU zoonoses liées aux tiques pour l’année scolaire 2023-2024
CC mSystems
Article

02 novembre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Un modèle génomique dynamique d'une bactérie clé de l’écosystème ruminal

Le microbiote du rumen joue un rôle essentiel dans la nutrition des ruminants en dégradant des aliments végétaux et les transformant en source d'énergie et de protéines pour l’animal. Dans le cadre d’une revue collaborative publiée dans mSystems et coordonnée par Rafael Muñoz-Tamayo de l’UMR Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants - MoSAR (INRAE/AgroParisTech/UPSaclay, Palaiseau), les auteurs se sont penchés sur la bactérie clé du rumen Fibrobacter succinogenes S85 qui dégrade la cellulose et produit du succinate.
INRAE B. Nicolas (Manipulation sous hotte aspirante)
Article

02 novembre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Un nouveau test fonctionnel pour l’analyse des variants d’épissage du gène DGAT1 bovin

Le gène DGAT1 joue un rôle majeur dans le métabolisme des graisses et la synthèse des triacylglycérides.
Sciences Animales Paris-Saclay
Article

14 septembre 2023

Rédaction: A. Jouneau - Edition P. Huan

Une protéine humaine pro-virale est essentielle au développement de l'embryon

Une nouvelle étude, menée par des scientifiques de l'université d'Uppsala (Suède) et de l’unité BREED (Université Paris-Saclay/INRAE), a découvert que la protéine hôte pro-virale ZC3H11A joue un rôle essentiel dans le maintien de la viabilité des embryons au début de leur développement. L'étude a mis en évidence une fonction jusqu'alors inconnue de ZC3H11A dans le processus complexe de la croissance embryonnaire et met en évidence son impact sur le développement. L’article est publié dans PNAS.
Article

27 novembre 2023

Rédaction: SAPS

Des unités membres de SAPS au Village des Sciences Paris-Saclay 2023 !

Des unités membres de SAPS, ainsi que la plateforme d’imagerie MIMA2 ont participé au Village des Sciences Paris-Saclay à l’occasion de la Fête de la Science 2023. à l'ENS Paris-Saclay.
@ INRAE Cheval 9052-007
Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Offre de Thèse CIFRE : "Lutte contre le Dopage Génétique chez le cheval"

Une thèse de doctorat labellisée CIFRE est proposée en collaboration entre le GIE LCH et l’équipe Biologie Intégrative et Génétique Equine (BIGE) de l’unité Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI - UMR 1313) de l’INRAE de Jouy-en-Josas afin compléter ses méthodes actuelles par de nouveaux outils innovants de détection du dopage génétique pour les courses hippiques et sports équestres.
Sciences Animales Paris-Saclay
Article

14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Une nouvelle piste génétique pour endiguer la propagation de la nodavirose, la maladie la plus répandue dans les élevages de bars en mer

Des équipes de l’Ifremer et d’INRAE viennent de découvrir deux gènes impliqués dans la résistance à la nodavirose, une maladie qui touche le cerveau des bars et cause des pertes importantes dans les élevages de Méditerranée. Suite à cette découverte publiée dans la revue Genetics Selection Evolution, les scientifiques et les professionnels des écloseries françaises de bars, qui fournissent plus de 20 % des bars élevés en Méditerranée (Italie, Grèce, Turquie...), ont démarré un nouveau projet pour sélectionner des bars plus résistants face à cette maladie. Un enjeu de taille pour tendre vers une aquaculture plus durable.
INRAE, Auteur Nicolas Bertrand (bassin de truites en pisciculture)
Article

02 novembre 2023

Rédaction: Edition P. Huan

Phénotypage de lignées isogéniques de truite pour élucider les mécanismes de résistance aux infections bactériennes

Dans une étude publiée dans Microbes & Infection, des chercheurs de l’équipe Infection et Immunité des Poissons (unité Virologie et Immunologie Moléculaires - VIM, INRAE/UVSQ/UPSaclay, Jouy-en-Josas), en collaboration avec les unités GABI et IERP de l’INRAE, ont établi un ensemble de phénotypes liés à la pathogenèse grâce à la caractérisation d’une collection de lignées isogéniques de truite à la résistance contrastée. Dans une démarche guidée par le principe des 3R, un suivi individuel par prélèvement sanguin non létal a été appliqué pour la première fois chez la truite pour suivre une infection bactérienne ainsi que la réponse de l’hôte ; cette approche permet à la fois de réduire le nombre de poissons utilisés et d’augmenter la puissance du dispositif expérimental.
P. Chavatte-Palmer INRAE
Article

14 septembre 2023

Rédaction: P. Chavatte-Palmer - Edition P. Huan

L'unité BREED a obtenu un projet INRAE-Linkage call avec le Département de Sciences Animales de l’Université de Floride.

Dans le cadre d'accords de coopération signés avec des organismes de recherche et certaines agences de financement étrangers, INRAE finance des projets de mobilité permettant à des chercheurs de travailler ensemble et développer des collaborations.
@ Alicia Jacques
Article

02 novembre 2023

Rédaction: A. Jacques - G. Restoux - Edition P. Huan

Réintroduction de diversité génétique dans les populations à partir de semence congelée : Le cas de l'Abondance, une race bovine locale laitière française

La diversité génétique correspond à la variabilité génétique entre individus d’une même population ou entre populations. Dans le cas des animaux d’élevage, les races sont souvent assimilées aux populations, et la diversité qu’elles contiennent est essentielle pour permettre leur évolution et leur adaptation. Cependant, la sélection consiste à choisir les meilleurs individus et ne permet donc pas de maintenir l’ensemble de la diversité des animaux. Toutefois, il est possible de congeler le sperme de taureaux afin de le conserver et potentiellement de l’utiliser plus tard.
Edition Quae
Article

14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Le livre « La biodiversité domestique : Vers de nouveaux liens entre élevage, territoires et société » vient de paraître aux Editions Quae.

Cet ouvrage réinterroge la diversité des populations animales utilisées en élevage ainsi que la place des races locales. La question de la diversité des animaux d’élevage est abordée en tenant compte de la pluralité des pratiques humaines pour la gérer, l’utiliser et la valoriser. Elle est aussi appréhendée au travers de ses relations avec le reste du vivant, la biodiversité sauvage notamment, que ce soit la diversité de la faune et de la flore dans les territoires d’élevage ou les pathogènes présents dans les milieux d’élevage.
@Kamphuis_Jasper_INRAE
Article

14 septembre 2023

Rédaction: INRAE - Edition P. Huan

Offre de thèse "Méthodes hologénomiques pour prendre en compte le microbiote de l’hôte dans les évaluations génétiques"

Le projet de thèse contribuera à établir des lignes directrices claires pour la simulation de données hologénomiques réalistes, la construction de matrices de similarité basées sur le microbiote, et la combinaison optimale de données génomiques, microbiotes, et multi-omiques dans une grande variété de scenarios.
Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Offre de thèse "Structure spatiale génétique et épigénétique de la population des races locales de poulets."

Financé par le projet européen H2020 GERONIMO, le projet de thèse propose d'étudier la structure génétique et épigénétique spatiale d'au moins 16 races locales européennes de poulets et leurs déterminants.
@ INRAE Photothèque, Atueur Gilles Vasseur Delaitre
Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Offre de thèse "Déterminisme génétique de la réponse vaccinale et de la composition du microbiote caecal chez la poule en élevage plein-air."

Cette thèse contribuera à produire des connaissances qui permettront d’accompagner le changement de pratiques, notamment en termes de gestion intégrée de la santé et du bien-être dans les élevages de volailles plein-air.
Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Offre de thèse "Taxonomie intégrative des tiques d’Afrique tropicale : actualisation des connaissances et anticipation de potentielles émergences de maladies à tiques en Europe."

La taxonomie des vecteurs constitue un des tous premiers prérequis indispensables au développement de méthodes de lutte antivectorielle, qu’elles soient préventives ou curatives. Ainsi, la connaissance des taxons en présence est fondamentale pour identifier les espèces de vecteurs compétents pour un agent pathogène donné, leur gamme d’hôtes et les biotopes auxquels ils sont associés, leur phénologie... Les épizooties observées en Europe au début du XXIème siècle et impliquant des diptères du genre Culicoides (Blue Tongue et Schmallenberg Virus…) ont illustré à quel point des lacunes de connaissances en matière de systématique des vecteurs pouvaient être un handicap pour les recherches sur ces maladies et la mise en place de plans de lutte.
Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Ekaterina Tomilina, doctorante de MaIAGE et GABI en finale du concours Ma Thèse en 180 Secondes à l’Université Paris-Saclay.

Son projet de thèse s’inscrit dans un projet de recherche aux interfaces des disciplines, puisqu’elle est couplée à une problématique biologique de l’INRAE concernant la fertilité des taureaux. Sa présentation a porté sur les méthodes à copules pour l'inférence de réseaux de régulation multi-omiques.
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Article

14 septembre 2023

Rédaction: SAPS - Edition P. Huan

Offre de thèse "Décrypter les variations phénotypiques des trois espèces de ruminants et comprendre leur évolution à l’aide de pangénomes."

Le projet de thèse proposé permet d’établir une nouvelle structuration des données génomiques sous la forme d'un graphe de pangénome. Il permet la compression sans perte de l'information de plusieurs centaines de génomes tout en préservant l'organisation chromosomique des gènes bovins, ovins et caprins. Ce nouveau type de ressources a prouvé son utilité chez la tomate pour améliorer la puissance de détection des variants génétiques à l’origine des variations phénotypiques d’intérêt agronomique